В 2000 году на базе Оренбургского государственного университета было основано государственное учреждение общеобразовательная школа-интернат «Лицей-интернат» (для одаренных детей сельских районов и малых городов Оренбуржья). Обучение проводилось по двум профилям: физико-математическому и естественно-научному. Бессменным научным руководителем лицея является доктор педагогических наук, профессор ОГУ Каргапольцева Н.А. Научный консультант – доктор педагогических наук, профессор, проректор ОГУ Кирьякова А.В.

Выпускники лицея – успешные студенты не только вузов города Оренбурга, но и университетов Москвы, Санкт – Петербурга, Екатеринбурга, Самары, Новосибирска, Челябинска и др. Это победители вузовских олимпиад, губернаторские стипендиаты, лучшие студенты города. 30 выпускников являются аспирантами вузов России.

В рамках реализации приоритетного национального проекта «Образование» в 2007 г. Лицей-интернат стал победителем конкурса общеобразовательных учреждений, внедряющих инновационные образовательные программы. Именно в этом году многое изменилось в лицее:
- юридический адрес (с пр. Победы,13 на ул.Советская,18);
- название (с государственного учреждения общеобразовательная школа-интернат «Лицей-интернат» (для одаренных детей сельских районов и малых городов Оренбуржья) на государственное учреждение общеобразовательная школа-интернат «Губернаторский многопрофильный лицей-интернат для одаренных детей Оренбуржья»);
- количество обучающихся (с 50 на 160 человек);
- количество профилей (с двух на четыре: физико-математический, химико-биологический, гуманитарный, социально-экономический);
- количество преподавателей (с 19 до 25 человек).

За время обучения в лицее выпускниками стали 335 человек, из них 123 – медалисты (37 – золотых, 86 – серебряных медалей).

Сегодня лицей-интернат – это инновационное учреждение, комплексно реализующее научно-разработанную систему подготовки одаренного ребенка к вступлению в самостоятельную жизнь.

Предметом деятельности лицея-интерната является:
1. Содержание, обучение и воспитание одаренных детей с учетом дифференцированного подхода к учебной деятельности и перспектив их перехода к вузовской степени обучения.      2. Воспитание чувства профессионального долга, создание условий для осознанного выбора профессии через внедрение вузовских технологий в учебно-воспитательный процесс учреждения.
3. Развитие творческой самостоятельности, инициативы, ответственности учащихся для раскрытия способностей и перспектив научного роста.

В лицее-интернате обучаются ребята из 44 районов Оренбургской области. Обучение проводится следующим образом:
- первая половина учебного дня – обучение по общеобразовательной программе с углубленным изучением профильных предметов;
- вторая половина учебного дня – учебно-исследовательская работа, участие в олимпиадном движении, занятия спортом и по интересам.

С первого сентября 2008-2009 учебного года в лицее-интернате учебный процесс осуществляют 25 педагогов. Обучение проводят учителя лицея, ведущих школ города, имеющие высшую квалификационную категорию, преподаватели вузов города, имеющие степень кандидата или доктора наук. В лицее-интернате имеются оборудованные классы химии, физики, информатики и мультимедийных технологий. Кабинеты оснащены компьютерами, проекторами, имеется интерактивная доска. Для работы учащимся предоставлен доступ к бесплатному интернету. Налажено тесное сотрудничество с Областной библиотекой им. Н.К.Крупской.

Особое внимание педагогическим коллективом лицея уделяется воспитательному процессу. Ежегодно проводятся традиционные лицейские праздники, конкурсы, конференции, спортивные соревнования. Организуются посещения учащимися выставок, музеев, театров, экскурсий и т.д. В лицее действует ученическое самоуправление – лицейская республика «РИТМ».

На базе лицея организована работа системы дополнительного образования по следующим направлениям:
- научно – исследовательская работа (Научное общество учащихся «Интеллектуалы XXI ВЕКА»);
- патриотическое (музей лицея, дискуссионный клуб «Отражение»);
- журналистское (Пресс-центр);
- художественно-прикладное (кружок «Рукодельница»); 
- эстетическое (команда КВН, клуб эстрадного танца);
- профориентационное (школа самоопределения, клуб «Лидер»);
- спортивно-оздоровительное (занятия по футболу, легкой атлетикой, настольному теннису, аэробикой).

Для учащихся лицея-интерната выделено комфортабельное общежитие. Комнаты рассчитаны на 2-3 человека. Ребята обеспечиваются бесплатным пятиразовым питанием.